Les 10 meilleures agences digitales à Lyon pour les PME et ETI en 2026

Installée à Lyon depuis 2004, Synolia s’est construite comme intégratrice : partenaire d’Adobe Commerce, d’OroCommerce, d’Akeneo et de HubSpot, elle travaille aussi sur Shopify et Sylius, assemble les briques et les fait parler entre elles. Pour Fermob, elle a conçu une plateforme B2B sous Adobe Commerce reliée à l’ERP, au PIM et au CRM du groupe, du cadrage en septembre 2021 à la mise en ligne en juin 2022. Pour le groupe Lafreto, la refonte de Lunettesdesoleil.fr sert de modèle pour migrer ses autres enseignes.

C’est la bonne porte quand le site marchand n’est qu’une pièce d’un ensemble plus large. Le groupe revendique plus de 160 personnes avec ses filiales Blackbird et W3lead, dont une centaine à Lyon.

ZOL a deux portes d’entrée. La première : construire un produit, e-commerce, application mobile ou plateforme. Gamm Vert lui doit un click & collect ouvert dans plus de 80 magasins en trois mois ; La Poste, un service de livraison de colis pour l’Afrique livré en huit mois. La seconde : remettre un système d’information d’aplomb. L’équipe cartographie les outils, les fait communiquer par API, centralise la donnée et développe l’application métier qui manque. Freyssinet, filiale de Vinci, lui a confié la digitalisation de la gestion de fabrication de ses ponts.

Pas de commerciaux chez ZOL : le premier rendez-vous se fait avec ceux qui feront le projet, au forfait ou en régie. L’agence dit ne plus prospecter et trouver l’essentiel de ses clients par recommandation ; elle en revendique plus de 300, et Point S comme Vinci Immobilier ont renouvelé pour 2026 et 2027 (Lyon Éco et Culture, octobre 2026). Ses références publiques sont surtout des groupes et des ETI, mais son dirigeant, Éric Boisson, estime que l’IA rend désormais le développement spécifique accessible à des PME qui ne pouvaient pas s’en offrir.

Née en 1999 sous le nom de 1ère Position, NOIISE compte 85 personnes, 125 depuis le rachat de l’agence de relations presse White Mirror fin 2025. Bpifrance est entré à son capital la même année. Elle couvre le référencement naturel, la visibilité dans les réponses des IA génératives (GEO), la publicité sur Google, Microsoft et les réseaux sociaux, les contenus et les relations presse.

Les prix suivent : Cas d’Or 2026 pour la stratégie multicanale de Maison Baumanière, prix spécial GEO aux SEMY Awards 2026. Le domaine skiable du Grand Massif est client SEO depuis 2018.

Créée en 2007, Axopen réunit une soixantaine de personnes, presque toutes techniques, dans le 6e arrondissement. Son terrain : les applications métier complexes, à construire ou, plus souvent, à reprendre. EDF lui confie depuis 2016 la maintenance du socle applicatif sur lequel reposent des applications de centrales hydrauliques, thermiques et nucléaires. Le Secours populaire lui a confié fin 2025 la maintenance de ses seize applications métier.

La palette technique est large, de Java à .NET, de PHP au mobile natif, et les audits (code, sécurité, accessibilité, éco-conception) sont vendus à part.

Depuis 2009, WanadevDigital fait tourner de la 3D en temps réel dans un navigateur : configurateurs de produits, planificateurs d’espaces, passage de la CAO à la 3D web. Pour RAJA, elle a bâti RAJA Print 2.0, qui génère automatiquement les fichiers d’impression des emballages personnalisés. Pour Leroy Merlin, un simulateur qui colorise vos photos d’intérieur avec les peintures de l’enseigne.

L’autre moitié du métier : moderniser des logiciels vieillissants. Pour Ergorecherche, elle a transformé Podofit, un logiciel de conception de semelles orthopédiques, en application web hébergée dans le cloud.

Fondée en 2004 et installée dans le 9e, Dedi Agency a choisi deux outils : Shopify Plus et Sylius. Elle a fait passer Facom sur Shopify Plus en 2024, près de 10 000 références dans un catalogue unique, après l’abandon d’un projet sous Salesforce Commerce Cloud. ZAG Skis a quitté Magento en 2025 pour une boutique avec configurateur de packs skis et fixations, reliée à SAP et HubSpot.

Côté B2B, l’agence a refondu fin 2025 le portail revendeurs de GIVI sous Sylius, connecté à l’ERP Sage. Son statut de partenaire Shopify Plus figure dans l’annuaire officiel de l’éditeur.

Vingt-huit personnes dans le 7e, trois métiers : la marque, le site, l’acquisition. Pilot’in construit des sites WordPress sur mesure, déploie HubSpot et forme les équipes de ses clients, en tant qu’organisme certifié Qualiopi. En 2026, elle a repositionné de bout en bout Systaly, une agence d’intérim lyonnaise : nom, plateforme de marque, identité, site.

Ses avis publics comptent parmi les meilleurs de la ville : 4,9 sur 5 sur 31 avis Sortlist. Depuis 2023, l’agence appartient au Groupe SRA, intégrateur de logiciels de gestion installé à Bron.

Kinoba, créée en 2017 dans le 3e, travaille de deux façons : elle construit des plateformes web sur mesure, ou elle renforce l’équipe technique d’un client. Dualsun, fabricant de panneaux solaires, l’a à ses côtés depuis novembre 2020 sur sa plateforme et son simulateur. La porcelaine Bernardaud lui a confié la reprise de son e-commerce la même année.

Spécialité récente : reprendre les produits construits vite, en no-code ou à coups d’IA, pour les rendre solides. L’agence affiche 5 sur 5 sur 24 avis Sortlist.

Sutunam conçoit des boutiques Magento 2 et Adobe Commerce sur Hyvä, un front qui les rend nettement plus rapides. Pour Bébé9 et ses plus de 100 magasins de puériculture, elle a migré la plateforme et synchronisé produits, prix et stocks avec l’OMS, l’ERP et le CRM. Pour MaxOutil, elle gère 45 000 références reliées à l’ERP.

Le tarif est affiché : à partir de 30 000 € HT pour une boutique Magento Open Source sur Hyvä avec des intégrations standards. La production est partagée entre Lyon et Hanoï, où l’agence a ouvert un bureau dès ses débuts en 2010.

Akaru, créée en 2008, revendique 35 Awwwards et 19 FWA, deux références des prix de design web ; son propre site a été « site du jour » sur Awwwards en avril 2024. Elle travaille surtout pour des marques grand public, du sport à l’art : Salomon, Asics, Decathlon, Aéroports de Lyon, la boutique de Richard Orlinski.

L’équipe est petite, onze personnes présentées sur le site, et fait partie depuis novembre 2025 du groupe Hula Hoop, agence de marque lyonnaise. Les boutiques sont construites sur Shopify.